一、叶子颜色及长短不同
石菖蒲叶子的颜色深绿色，长50公厘米，
水菖蒲叶子的颜色稍浅，长120厘米。
二、开花形状及开花时间不同：
石菖蒲的花的形状是三棱状，颜色为浅绿色，开花期在2月上下。
水菖蒲的花的形状是圆柱形，颜色是黄色，开花期在6到9月，
两者区别为来源不同。远志来源于远志科远志属多年生草本植物。别名棘菀、线儿茶。菖蒲来源于天南星科，菖蒲属多年生草本植物。
小菖蒲和石菖蒲都是美丽的水生植物，但家养上来说，小菖蒲更容易养活。小菖蒲喜欢充足的阳光和湿润的土壤，适应性强，生长快速。石菖蒲需要特殊的生长环境，如碱性土壤和湿地。同时，小菖蒲的花朵更加绚丽多彩，更受人喜爱。所以，在家养方面，小菖蒲更容易护理和欣赏。
